Для начала регистрируем аккаунт на metrika.yandex.ru, добавляем счетчик, получаем код вызова(я делал без информера, с информером надо устанавливать в другое место в (footer.php)).
Далее в админке WordPress редактируем файл header.php из вашей темы (Внешний вид>Редактор>header.php), вставляем код вызова яндекс-метрики после строки
<body <?php body_class(); ?>>
Вот и все.
